trRosettaRNA2 利用二级结构 (SS) 做了两件很有意思的工作 让SS加权于attention 通过多 SS 条件输入实现 RNA 构象分布 SS加权于attention trRosettaRNA2 除了将ss作为一层feature，...

问题背景：Docker 挂载单个文件在使用 Docker 时，我们经常会把配置文件通过 bind mount 挂载到容器中。例如： 12345services: web: image: my-app volumes: - ./...

一、系统配置更新系统1apt update && apt full-upgrade -y && apt autoremove -y && apt autoclean -y 安装常用工具1apt inst...

背景我们课题组计算集群使用的glib版本是2.17，这导致了一些较新的科学计算库在安装或使用时出现问题。查看glibc版本方法： 1ldd --version Multimolecule安装首先通过conda安装pyarrow 1conda inst...

软件安装安装Python12sudo apt updatesudo apt install python3.12 python3.12-venv -y 安装Supervisor和NGINX1sudo apt install supervisor ng...

最近在将自研小程序从测试版发布到正式版时，遇到了一个非常奇怪的坑：接口在本地开发和测试环境中一切正常，但一旦发布到正式版，就出现了 code 600002 的报错，提示 URL not in domain list。 问题现象 接口本地测试完全正常。...

问题背景使用家用Wi-Fi部署一些服务后，要访问的话，打ip地址太长了，让不懂web手打地址更是灾难。因此，路由器自定义host是一个好的方案。 问题表现自定义host后 ✅ 自定义域名能ping通 ✅ 通过ip能访问服务 ❌ 无法通过域名访问服务...

在深度学习微调大模型时，LoRA（Low-Rank Adaptation） 提供了一种高效、轻量的微调方法。本文讲述了LoRA的原理，同时结合一个小型 MNIST 实验做了验证。 1. LoRA 的核心思路在训练大模型时，通常模型参数量巨大，直接微调...

模型架构RhoFold+是一个全可微分的端到端框架，从RNA序列输入直接输出全原子3D结构。架构分为几个关键模块： 输入处理和特征提取： RNA-FM：一个12层Transformer模型，预训练于~23.7百万未标注RNA序列（来自~80万种物...

深度学习环境搭建（Anaconda、CUDA13.0、cuDNN）如果不是从源码构建，那么Pytorch和OpenMM安装不需要CUDA13.0和cuDNN。 Anaconda/Miniconda安装 Miniconda — Anaconda 文档 ...